在WB實(shí)驗(yàn)中,判斷蛋白質(zhì)表達(dá)的陽(yáng)性結(jié)果主要是通過觀察和分析經(jīng)過特定抗體識(shí)別及信號(hào)放大的目標(biāo)蛋白質(zhì)條帶來進(jìn)行的。具體來說,可以從以下幾個(gè)方面綜合考慮:
1、條帶清晰度與位置
首先,觀察目標(biāo)蛋白質(zhì)對(duì)應(yīng)的條帶是否清晰可見,且位置與預(yù)期一致。理想的陽(yáng)性結(jié)果表現(xiàn)為一條或多條明確、密集、界限分明的條帶,出現(xiàn)在預(yù)計(jì)的分子量范圍內(nèi)。條帶的位置可以通過與已知分子量的標(biāo)準(zhǔn)對(duì)照(Marker)比較來確定。如果條帶位置與Marker對(duì)應(yīng)的目標(biāo)分子量吻合,則說明抗體確實(shí)識(shí)別到了目標(biāo)蛋白質(zhì)。
2、信號(hào)強(qiáng)度
正常情況下,陽(yáng)性結(jié)果的條帶信號(hào)強(qiáng)度應(yīng)該明顯高于背景噪聲,這意味著抗體與目的蛋白之間的特異性結(jié)合足夠強(qiáng),足以從復(fù)雜的蛋白混合物中區(qū)分出來。對(duì)于定量分析,可以使用軟件量化條帶的灰度值或熒光強(qiáng)度,與陰性對(duì)照或內(nèi)參蛋白進(jìn)行比較,以確定目標(biāo)蛋白的相對(duì)表達(dá)水平。
3、重復(fù)性驗(yàn)證
科學(xué)研究講究嚴(yán)謹(jǐn)和重復(fù)性,單一實(shí)驗(yàn)的結(jié)果不足以完全證實(shí)結(jié)論。因此,在初次實(shí)驗(yàn)得到陽(yáng)性結(jié)果后,建議進(jìn)行多次獨(dú)立實(shí)驗(yàn)以驗(yàn)證結(jié)果的一致性。同樣條件下,如果多次實(shí)驗(yàn)都能重現(xiàn)相同的條帶位置和信號(hào)強(qiáng)度,那么該結(jié)果的可信度就大大提高。
4、抗體特異性
使用的一級(jí)抗體必須具有高特異性,僅與目標(biāo)蛋白結(jié)合而幾乎不與其他無關(guān)蛋白交叉反應(yīng)??梢酝ㄟ^預(yù)先做抗體稀釋梯度實(shí)驗(yàn)、阻斷實(shí)驗(yàn)等方式,驗(yàn)證抗體的特異性。此外,如果可能的話,采用兩種以上的獨(dú)立抗體對(duì)同一樣本進(jìn)行WB實(shí)驗(yàn),如果能得到相同的結(jié)果,將進(jìn)一步加強(qiáng)陽(yáng)性結(jié)果的說服力。
5、對(duì)照設(shè)置
設(shè)置合適的對(duì)照是判別陽(yáng)性結(jié)果的另一個(gè)重要因素。通常包括:
a.陰性對(duì)照:使用不含目標(biāo)蛋白的樣本,或者使用抗體吸附去除目標(biāo)蛋白的樣本,以確認(rèn)條帶出現(xiàn)是由目標(biāo)蛋白引起的。
b.陽(yáng)性對(duì)照:包含已知高表達(dá)目標(biāo)蛋白的樣本,作為實(shí)驗(yàn)成功的參照。
c.空白對(duì)照:無樣本直接加二抗的情況,用于評(píng)估背景水平。
d.內(nèi)參蛋白:如β-actin、GAPDH等,用于校準(zhǔn)樣品裝載量和轉(zhuǎn)移效率,以排除因這些因素造成的假陽(yáng)性。
通過綜合考量以上各方面,結(jié)合具體的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和目的,才能準(zhǔn)確判斷WB實(shí)驗(yàn)中蛋白質(zhì)表達(dá)的陽(yáng)性結(jié)果。在整個(gè)過程中,嚴(yán)謹(jǐn)?shù)膽B(tài)度和細(xì)致的數(shù)據(jù)記錄是非常重要的,它們有助于確保實(shí)驗(yàn)結(jié)果的真實(shí)性和可靠性。