Weatern blot原理
蛋白質(zhì)印跡(Western Blot,WB)又稱為免疫印跡(Immunoblot),其是利用SDS聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)將樣品中分子量大小不同的蛋白分開(kāi),然后通過(guò)電轉(zhuǎn)移的方法將凝膠中的蛋白幾乎原位、定量地遷移、固定到固相膜上,再利用抗原、抗體的特異性結(jié)合反應(yīng)以及特殊的抗體標(biāo)記技術(shù),進(jìn)而對(duì)目的蛋白進(jìn)行定性、相對(duì)定量檢測(cè)的技術(shù)。
常見(jiàn)問(wèn)題
Q
蛋白提取后可以存放多久?
A:
蛋白提取后-80℃可保存一年。建議分裝保存,避免反復(fù)凍融。
Q
蛋白提取時(shí)用進(jìn)行超聲破碎嗎?
A:
一般建議進(jìn)行超聲處理,這樣可使樣本裂解更充分,對(duì)于核蛋白、核染色質(zhì)相關(guān)蛋白等難提取、復(fù)雜的蛋白,超聲處理是關(guān)鍵因素。
Q
做組織樣品蛋白的WB的時(shí)候,提取蛋白
有什么特別注意的嗎?
A:
必須進(jìn)行研磨、勻漿處理,做超聲處理,使蛋白質(zhì)溶解度會(huì)更好,離心要充分。組織中的蛋白酶活性更強(qiáng),需要加入抑制蛋白酶活性的抑制劑,防止蛋白降解。
Q
蛋白含量測(cè)定方法的選擇?
A:
提取的樣品中若含有去垢劑則需要選用BCA法進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定,若樣品中含有螯合劑(EDTA,EGTA)、還原劑(DTT,巰基乙醇)和脂類等,則需要選用Bradford法進(jìn)行蛋白濃度測(cè)定。
Q
WB實(shí)驗(yàn)中樣品上樣量是多少?
A:
細(xì)胞裂解物或組織勻漿的總蛋白的上樣量一般為20-40μg,純化蛋白的上樣量一般為10-100ng。
Q
WB實(shí)驗(yàn)中一般需要多少個(gè)細(xì)胞?
A:
一般5×106足夠。但要看是哪種細(xì)胞,有的細(xì)胞的體積就很小,而有的細(xì)胞則鋪得很開(kāi)。常規(guī)做WB一個(gè)孔道上樣要105個(gè)細(xì)胞。但也和目的蛋白及提取的方式有關(guān)。如果是膜蛋白或是某細(xì)胞器內(nèi)分布的蛋白細(xì)胞數(shù)得增多。
Q
電泳后為什么會(huì)出現(xiàn)“微笑”或
“倒微笑”條帶?
A:
a)“微笑”是因?yàn)楣嗄z的時(shí)候冷卻不均勻,中間部分冷卻不好,導(dǎo)致凝膠中的分子有不同的遷移率所致。
b)“倒微笑”現(xiàn)象常常是由于垂直電泳時(shí)電泳槽的裝置不合適引起的,特別是當(dāng)凝膠和玻璃板組成的三明治底部有氣泡或靠近隔片的凝膠聚合不*,加APS和TEMED后應(yīng)該混合均勻。
c)電泳和轉(zhuǎn)膜溫度過(guò)高,點(diǎn)樣量太多或每孔點(diǎn)樣量不均勻,電泳電壓不穩(wěn)定或過(guò)高都可能引起條帶不整齊的現(xiàn)象。
Q
轉(zhuǎn)膜注意事項(xiàng)?
A:
a)濾紙、膠、膜之間的大小,一般是濾紙≥膜≥膠。
b)濾紙、膠、膜之間千萬(wàn)不能有氣泡,氣泡會(huì)造成短路。
c)保持膜的濕潤(rùn),若FVDF膜干燥,需要重新用甲醇活化。
Q
脫脂奶粉和 BSA 封閉有區(qū)別嗎?
A:
一般來(lái)講,BSA 會(huì)產(chǎn)生更清晰的結(jié)果,因?yàn)?BSA 含有較少的蛋白,抗體與之發(fā)生交叉反應(yīng)的概率較低。但并非總是如此,有些抗體在脫脂奶粉中的封閉效果更好,因?yàn)槊撝谭壑泻懈喾N類的封閉蛋白,能封閉更多不同類型的蛋白質(zhì)。
Q
一抗二抗用什么稀釋?
A:
一抗可用封閉液稀釋。二抗可用TBST稀釋,若感覺(jué)背景高也可以用封閉液進(jìn)行稀釋。若使用商品化的WB抗體稀釋液,則需要注意稀釋液中是否還有防腐劑(NaN3),若含有則不能稀釋HRP標(biāo)記二抗。
Q
目的蛋白分子量為何與實(shí)際不符?
A:
a)翻譯后修飾:蛋白發(fā)生如磷酸化、糖基化等翻譯后修飾時(shí)分子量會(huì)增加;
b)翻譯后剪切:蛋白發(fā)生剪切時(shí)分子量會(huì)降低,某些蛋白在合成時(shí)是作為前提蛋白合成的,然后剪切形成活性形式;
c)剪切異構(gòu)體:同一基因經(jīng)不同剪切方式可能產(chǎn)生不同大小的蛋白;
d)多聚體:比如蛋白二聚化;
e)電泳,膠濃度,蛋白Marker等因素也會(huì)影響實(shí)際蛋白分子量的判斷。
Q
內(nèi)參抗體的選擇?
A:
a)內(nèi)參與目的蛋白分子量相差5KD以上
b)不同組織樣本在選擇內(nèi)參時(shí)存在一定差別
Q
WB實(shí)驗(yàn)結(jié)果條帶很弱或者無(wú)目的條帶
A:
Q
WB實(shí)驗(yàn)結(jié)果非特異性條帶多
A:
Q
WB實(shí)驗(yàn)結(jié)果背景偏高
A:
Q
WB實(shí)驗(yàn)中其他常見(jiàn)的問(wèn)題
A:
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